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    细菌基因组完成图测序

     

             随着基因组研究的迅速发展,全基因组测序已逐步成为微生物基础研究的重要手段之一。通过基于PacBio第三代测序和Illumina二代测序,根据菌株具体情况制定最优策略,最终得到一条完整的基因组序列(1 contig,0 gap),是细菌基因组测序的最高要求。

     

    ●  技术流程

                                             

     

     

    ●  技术方案

     

                                     

                     细菌基因组完成图

     

     

     

    ●  技术指标

     

     

     

     

    参考文献

    1、Samina Mehnaz et al. Complete Genome Sequence of the Sugar Cane Endophyte Pseudomonas aurantiaca PB-St2, a Disease-SuppressiveBacterium with Antifungal Activity toward the Plant Pathogen Colletotrichum falcatum. Genome Announc.2014 vol. 2 no. 1 e01108-13

    2、Koren et al. Reducing assembly complexity of microbial genomes with single-molecule sequencing. Genome Biology 2013, 14:R101

    3、Bashir, et al. A hybrid approach for the automated finishing of bacterial genomes, Nature Biotechnology 2013, 30,701–707